Приказом министерства образования Российской Федерации № 2213 от 31.05.2001 года открыта докторантура по двум специальностям:

14.03.03. – Патологическая физиология;
14.01.17. – Хирургия.

В докторантуру принимаются лица, имеющие степень кандидата наук. Подготовка докторантов осуществляется по очной форме. Срок обучения в докторантуре – 3 года.Срок подготовки в докторантуре засчитывается в стаж научно-педагогической и научной работы. За докторантами сохраняются все права по месту работы, которые они имели до поступления в докторантуру (право на получение жилой площади, на присвоение ученого звания и другие), а также право на возвращение на прежнее место работы.

Перечень документов для поступления в докторантуру:

• Заявление на имя ректора.
• Копия диплома о присуждении ученой степени кандидата наук.
• Анкета.
• Развернутый план подготовки докторской диссертации.
• Список опубликованных научных работ и изобретений.
• Документ, удостоверяющий личность (предъявляется лично).

Лица, зачисленные в докторантуру, освобождаются от занимаемых должностей в соответствии с трудовым законодательством РФ. Зачисленным за счет средств бюджета стипендия выплачивается со дня зачисления, но не ранее дня увольнения с предыдущего места работы.

В период подготовки докторант обязан выполнить план подготовки диссертации и представить завершенную диссертацию на кафедру или отдел, лабораторию, совет для получения соответствующего заключения.

Докторантам предоставляются ежегодные каникулы продолжительностью 2 месяца. Докторанты имеют право на оплачиваемую работу при условии выполнения ими плана работы над диссертацией.

По существующим специальностям докторантуры в Читинской государственной медицинской академии сформировались научные школы.

Среди физиологов и патофизиологов особо хочется отметить заслуженного деятеля науки РФ, профессора, члена многих отечественных и зарубежных академий Б.И.Кузника, под руководством которого защитилось около 200 кандидатов и докторов наук. Его учениками являются профессора ЧГМА Н.Н.Цыбиков, И.С.Пинелис, Л.П.Малежик, Ю.А.Витковский и многие другие. Все они также плодотворно работают и готовят докторов и кандидатов наук. Большой вклад в подготовку кадров по специальности «патологическая физиология», которые успешно трудятся на теоретических и клинических кафедрах ВУЗа, в органах практического здравоохранения внесли профессора А.В.Говорин, Б.С.Хышиктуев, Н.В.Говорин, Т.Е.Белокриницкая.

Не меньшую роль в формировании научного потенциала академии внесли и хирурги. У истоков хирургической школы стояли такие известные профессора, как Н.И.Иорданская, Д.И.Даренский М.М.Рожинский и другие. В настоящее время подготовка специалистов по хирургии ведется профессорами С.Л.Лобановым, В.Ю.Погребняковым, Н.И.Богомоловым, В.А.Сизоненко.