Основные задачи НИИ - развитие фундаментальных поисковых и прикладных исследований в области медицинской экологии, разработка, совершенствование и внедрение современных методов исследований в науку, и практическое здравоохранение, подготовка высококвалифицированных научных и научно-педагогических кадров. Лаборатории НИИ ведут исследования по влиянию факторов окружающей среды на функции организма: иммунологические, эндокринные, гемостаз, перекисное окисление липидов и др.

НИИ медэкологии располагает высоким научным потенциалом и выполняет современные исследования в области биологии и медицины:

• Биохимические (определение концентрации гормонов, микроэлементов, спектр жирных кислот, перекисного окисления липидов, определение фармакокинетики лекарственных препаратов и др.).
• Иммунологические (фенотипирование иммунокомпетентных клеток, оценка функционального состояния лимфоцитов, фагоцитов, лимфоцитарно-тромбоцитарной адгезии, определение концентраций иммуноглобулинов, цитокинов, ростовых факторов, выявление специфических антител к факторам групповой принадлежности крови, эритроцитам, тромбоцитам и т.п.).
• Система гемостаза (изучение адгезивной и агрегационной функций тромбоцитов, включая выявление аспиринорезистентности, выполнение стандартизованных коагуляционных тестов МНО, АЧТВ и др., а также определение концентрации факторов гемокоагуляции и антикоагулянтов, оценка состояния фибринолитического звена).
• ПЦР-диагностика (выявление протромбоических мутаций - фактора V (Лейден), протромбина, метилентетрагидрофлолатредуктазы и др., исследование полиморфизма генов адгезивных молекул, цитокинов, ростовых факторов и рецепторов к ним) и т.п.

В лабораторных исследованиях используются методы световой и люминесцентной микроскопии, иммуногистохимии, иммуноферментного анализа, спектрофотометрии, биохимии, высокоэффективной жидкостной хроматографии, молекулярной генетики и др.

НИИ медэкологии предлагает препараты для человека и животных на основе природных цеолитов Шывыртуйского месторождения, обладающих свойствами сорбентов с добавлением биологически активных добавок (БАД):

• «Цесейдин» с включением БАД, содержащих селен и йод;
• «Цесейдин» бадановый;
• «Цесейдин» дрожжевой (БАД - селен-метионин).

Для коррекции селена в растениях зерновых, овощных и плодово-ягодных культур НИИ медэкологии рекомендует «Селеновое микроудобрение Вощенко» 6 видов, созданных на основе селенита натрия и цеолита-шивыртуина.